女娲是伏羲的同胞妹妹。伏羲在建都宛丘之后，曾亲自回到成纪迎请母亲和妹妹来陈都，女娲一路见男女野合，知爱而不知礼，谓伏羲曰：「为教之先应先立人伦，立人伦必先定嫁娶。如今姓氏颇多，不可同姓为婚。凡欲嫁娶时，先使一人斟酌其事，谓之媒妁，然后以俪皮为聘礼，示合姓之欢。行聘礼之后，双方虽未正式嫁娶，也不得与他人游戏，则人伦之本立，而民始不相渎也。」伏羲大喜：「此言有理啊！我妹能正姓氏，职婚姻，民得女判，可呼为神媒。」随即晓谕天下，百姓自此婚姻皆行此礼。所以中国自古有传说女娲是媒神，主人婚姻，源自于此也。
伏羲离去后，众人推女娲为王，称为女皇。
共工氏，名康回，生得髦身朱发，铁臂虬筋，身高一丈有余，力大无穷。其为人表面恭敬但内心狡诈，阴谋百出，碍于伏羲的威德而暂时隐忍为上相。如今听说群臣推女娲为主，怒不可遏，乃倚仗自己封地地势高险，决滔天洪水以淹陈都。
霎时中原遍遭水害，天地间一片汪洋。女娲与群臣避入中皇山，中皇山乃中央的封地，中央五行为土，土能克水，所以其封地洪水不能近，只是当时中央已不在。下相柏皇进策曰：「臣闻衡山之阳有祝融氏之后名曰莫坏者，得异人传授，可制此水。」女娲命使者招至。莫坏乃教聚芦苇烧成灰壅塞于低处，洪水之势立见消减。共工见女娲用莫坏之谋止其洪水，又心生毒计，他派人巴结其邻里栗陆，许以厚酬，密定共同决水再淹中原。栗陆利欲薰心，马上叫国人注水决堤。
共工和栗陆在堤边亲自督战，堵住各处出水口，截住滔天巨浪蓄积水势，只待水满便要开堤冲下。千钧一发之刻莫坏率无数人民执火棒火器攻打而至，一时烟乘风势扑面迷睛，共工大叫决堤，但左右大乱，自相践踏哭爹喊娘。而此时洪水却越涨越高眼看冲出堤围，忽然如一声暴雷炸向，只见亿万倾巨浪凭空倒悬立起，向山头高处逆流而上，刹那间将共工的封地夷为深渊。
共工之民惊呆了，遍弃水具跪伏于地；栗陆的人民早已恨其叛乱，此时发一声喊立刻把栗陆杀了。共工在仓惶之间向东奔投尊卢，尊卢拒之，共工只得向西而来，遥见一山壁立万仞，顶有石柱危峻屹立直插云汉。共工爬到山顶，山顶竟有一汪清池可饮，池边尚有芬芳的野果可食。共工想起昔日自己的封地也是如此美好，如今却落到这步田地，越想越怒越想越恨……一股邪恶之气直冲天庭，他双手抱定石柱大吼一声，一头撞向石柱，石柱崩断，发出天裂一般的巨向，从山上滚下，所遇树木山石尽被碾为粉末，幸而山高树多，石柱下滚之速略受羁滞。
女娲在山下见了，急命断巨木为海螯之足，立于地之四极，石柱轰鸣坠至，女娲役其神力一掌抵住，将天柱支驾于四足之上，此时地震天摇，大地向东南倾斜，四极下陷，从此河海尽皆东流，四极陷为冰川海洋。
莫坏与人民攀山而上穷追不舍，共工乘夜逃走，西奔至昆吾之境，昆吾早已令人执剑四面守定；共工不得入，又奔至骊连地畀，骊连迎接了他，好言安慰，共工疲惫已极，就呼呼睡著了。骊连令人以牛筋将共工五花大绑，解来见女娲，女娲亲握昆吾之剑，历数其罪而杀之。将其封地分与尊卢、骊连、昆吾三人治理。
女娲率众回都，见宛丘已被水破坏不堪居住，就建都于中皇山之阴。
共工撞断天柱之后，天柱崩倒于山南一带，从此山南一带不能周匝行人，故人民称此山为「不周山」。共工怨气结滞于山顶不散，一团阴郁阳光不至，所以这一带常常凄风苦雨，人民难以存活，乃哭告于女娲。女娲即与众人运五色巨石至不周山顶，按五行的方位安放好巨石，候东南风起，驾起大木以火烧之，并令一对童男童女持巨扇鼓风，不时加木助火。烧至第七日，只见巨石散发出五色的阳气向天空冲去，阴翳消除，晦雨逝去，天色一片明朗祥和，有几缕五色气因风吹而飘到了天边，成了美丽的云霞，从此朝朝暮暮现于天边。
到此时四方回复安宁，天地回复生机。大臣随造笙簧，以通达各国不同的民风；□陵制都良管，以协调所有乐器之音；圣造班管，择清晨吹之，日月星辰各自灿烂光明。女娲觉得这段时日杀伐太重，心中略感悲伤，即造了一张五十弦的瑟，长七尺二寸，命素娥鼓之，顿时愁云四塞阴雾迷空，音色杂乱听之极悲。女娲知用弦太过，命将此瑟尺寸与弦各折一半，瑟身绘画锦文饰以宝玉，以抑其悲，然后弹之，天地清明幽微各得其理也。这张瑟的尺寸也一直沿用到今天。
女娲见人民披头散发无异阴鬼，就教人民将长发盘上头顶，用竹片插牢，再用细细的带子加以束定，看起来非常整齐端庄。天下纷纷仿效，自此人民懂得了修饰仪容，中原的风俗也大为改观，这就是头饰与发簪的由来。女娲还常常乘坐六条飞龙拖拽的雷车巡视天庭，以保护天上地下的安宁。